Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TUFT1-204ENST00000392712 2946 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC111182.1-201ENST00000588701 3419 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ARHGEF9-221ENST00000635967 2179 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LTF-201ENST00000231751 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PNMA6F-201ENST00000436629 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CPEB4-207ENST00000519835 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SLAMF7-205ENST00000444090 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SPRTN-204ENST00000391858 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 TNFSF10-202ENST00000420541 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 FAM71F1-201ENST00000315184 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 AC073476.3-201ENST00000563949 2507 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 MIR9-3HG-203ENST00000546186 2718 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 GTPBP2-201ENST00000307114 2830 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 RBM24-201ENST00000318204 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
COLCA2A8K830 TRAF3IP2-202ENST00000359831 2264 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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