Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
KNCNA6PVL3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KNCNA6PVL3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms