Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MAP1LC3B2A6NCE7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms