Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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