Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL121895.1-202ENST00000441208 2701 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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SPOCK3Q9BQ16 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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SPOCK3Q9BQ16 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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SPOCK3Q9BQ16 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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SPOCK3Q9BQ16 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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SPOCK3Q9BQ16 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN30-211ENST00000610712 3439 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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