Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL512791.2-201ENST00000615251 4609 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms