Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACAP3Q96P50 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACAP3Q96P50 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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