Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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UBXN4Q92575 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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UBXN4Q92575 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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UBXN4Q92575 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBXN4Q92575 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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