Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBL4BQ8N7F7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms