Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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CLIP4Q8N3C7 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CLIP4Q8N3C7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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