Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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