Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TIAM2-201ENST00000275246 2491 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LINC01122-207ENST00000452840 4077 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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