Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 DPY19L3-201ENST00000342179 6015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 SLCO2A1-201ENST00000310926 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 VGLL4-201ENST00000273038 3725 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ANKRD62-202ENST00000587848 2919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ST3GAL5-254ENST00000640322 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ELP4-212ENST00000638764 2456 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC002480.2-201ENST00000435127 2432 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 DEDD-210ENST00000490843 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 COX19-201ENST00000344111 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 KIAA0319L-202ENST00000373266 2377 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 AC097652.1-201ENST00000511385 2114 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ADGRF3-201ENST00000311519 3240 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 MRVI1-215ENST00000541483 2468 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 TRAF3IP3-202ENST00000367024 2331 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 ILK-202ENST00000396751 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
UBE2V1Q13404 MAP10-201ENST00000418460 3516 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FAM214B-201ENST00000322813 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NCAM1-230ENST00000621850 2787 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CLIP3-201ENST00000360535 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC005072.1-201ENST00000606640 1779 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC080112.4-201ENST00000623156 2491 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HNRNPH2-201ENST00000316594 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms