Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PPP3CAQ08209 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms