Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2P78314 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2P78314 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms