Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RPS29P62273 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RPS29P62273 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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