Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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