Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP8P40818 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP8P40818 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP8P40818 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP8P40818 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP8P40818 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP8P40818 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms