Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms