Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms