Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
XBP1P17861 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
XBP1P17861 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
XBP1P17861 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms