Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BRAFP15056 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BRAFP15056 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
BRAFP15056 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
BRAFP15056 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BRAFP15056 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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