Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms