Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms