Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22BO75396 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22BO75396 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22BO75396 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22BO75396 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22BO75396 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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SEC22BO75396 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SEC22BO75396 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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SEC22BO75396 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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