Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GGTLC3B5MD39 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GGTLC3B5MD39 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms