Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF24Q9UPV7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms