Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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USP35Q9P2H5 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP35Q9P2H5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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