Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
A4GALTQ9NPC4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms