Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC17Q9NP64 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms