Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SYNGAP1Q96PV0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYNGAP1Q96PV0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms