Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF397Q8NF99 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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ZNF397Q8NF99 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNF397Q8NF99 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNF397Q8NF99 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNF397Q8NF99 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZNF397Q8NF99 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF397Q8NF99 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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