Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms