Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ASPRV1Q53RT3 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ASPRV1Q53RT3 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms