Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TCTE1-202ENST00000371505 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RCAN1-202ENST00000381132 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H3G-201ENST00000614378 2411 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 XIAPP2-201ENST00000527404 1852 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL122035.2-201ENST00000609125 1870 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF304-204ENST00000598744 3331 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ICA1-204ENST00000396675 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MDH1B-201ENST00000374412 2553 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TACC1-211ENST00000520973 2564 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CELF2-AS1-201ENST00000379256 2468 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC079465.1-201ENST00000416046 3361 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ITIH1-211ENST00000537050 2493 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FCGR3A-202ENST00000367969 2385 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATF3-206ENST00000366987 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms