Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms