Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CTF1Q16619 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CTF1Q16619 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CTF1Q16619 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CTF1Q16619 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CTF1Q16619 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CTF1Q16619 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CTF1Q16619 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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CTF1Q16619 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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