Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CACNA1SQ13698 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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