Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL4BQ13620 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL4BQ13620 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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