Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRB1P82279 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CRB1P82279 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms