Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX3P78415 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX3P78415 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRX3P78415 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms