Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC092335.1-201ENST00000509037 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RAB4BP61018 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms