Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RASA1P20936 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms