Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CD28P10747 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CD28P10747 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CD28P10747 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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CD28P10747 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CD28P10747 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CD28P10747 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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CD28P10747 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CD28P10747 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CD28P10747 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CD28P10747 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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