Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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