Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID3CA6NKF2 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID3CA6NKF2 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms