Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LRIT1Q9P2V4 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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