Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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