Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM6Q9C030 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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