Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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